Yuya Wakamatsu syntyi 9. helmikuuta 1995 Satsumasendaissa, Japanin pääsaaren Kyushun eteläisimmässä kärjessä Kagoshiman prefektuurissa. Nuorena, hieman kapinallisena teini-ikäisenä hän muutti Tokioon, missä liittyi Tribe Tokyo MMA -seuraan nimenomaan treenatakseen Ryo ”The Piranha” Chonanin johdolla. Chonan oli entinen PRIDE-ottelija ja kaksinkertainen DEEP-maailmanmestari, ja Wakamatsu ottaisi myöhemmin tämän lempinimen kunnianosoituksena mentorilleen. Chonanista tuli Wakamatsulle paljon enemmän kuin valmentaja: hän tuki tätä henkilökohtaisten kriisien läpi, muun muassa joukkuetoveri Iyori Akiban kuolemaan johtaneen moottoripyöräonnettomuuden jälkeen vuonna 2016, sekä kannusti häntä opiskelemaan englantia ja kehittymään yhteisön arvostetuksi jäseneksi.
Wakamatsu rakensi maineensa Pancrasessa, jossa hän voitti vuonna 2016 22. Pancrase Neo Blood -perhosarjan turnauksen, sekä uransa alkuvaiheessa vaikuttavalla yhdeksän ottelun voittoputkella, josta kahdeksan päättyi tyrmäykseen. ONE Championshipissä hän kohtasi perhosarjan kärkikastin ottelijoita, kuten Demetrious Johnsonin, Danny Kingadin ja Adriano Moraesin.
Hänen uransa huipentui 23. maaliskuuta 2025 ONE 172 -tapahtumassa, kun hän kukisti Adriano Moraesin teknisellä tyrmäyksellä ja voitti ensimmäistä kertaa ONE:n perhosarjan MMA-maailmanmestaruuden. Hän puolusti mestaruuttaan menestyksekkäästi Joshua Paciota vastaan ONE 173 -tapahtumassa. 29. huhtikuuta 2026 Wakamatsu kuitenkin menetti mestaruutensa tyrmäyksellä Avazbek Kholmirzaeville ONE SAMURAI 1 -tapahtumassa toisen erän ajassa 4:53. Vetäytymisen sijaan hän ilmoitti tavoittelevansa mestaruutta takaisin. 12. syyskuuta 2026 hän ottaa ONE SAMURAI 3 -tapahtumassa Yokohamassa ensimmäisen askeleensa kohti mestaruutta kohdatessaan Willie van Rooyenin.