Gammel khmerisk kampkunst
Ifølge den mundtlige overlevering går Bokator tilbage til før grundlæggelsen af Angkor. Nogle kilder nævner endda det første århundrede e.Kr., men denne datering er ikke blevet uafhængigt fastslået. Indskrifter fra det syvende århundrede viser dog, at kampkunst, brydning og beskyttelsen af riget var vigtige temaer.
Indskrifter fra det niende og tiende århundrede beskriver brydere, boksere og kampfærdigheder ved khmerhoffet. Skulpturer ved blandt andet Bayon og Koh Ker viser stillinger og kampscener. Dette er bevis på en historisk khmerisk kampkultur, ikke automatisk på en moderne, uændret Bokator-tradition.
Det tyvende århundrede og afbrydelsen
Franske kilder fra 1905 og 1907 beskriver khmerisk boksning, stavkamp og brydning som populære indslag ved fester. I 1920'erne blev buddhistiske munkes muligheder for at undervise i og udøve khmerisk kampkunst ifølge historiske kilder begrænset af kolonistyret.
Under krigene og de politiske omvæltninger i 1970'erne blev mange traditionelle overleveringslinjer afbrudt. Under De Røde Khmerers regime forsvandt lærere, elever og dokumentation. Det præcise omfang af tabet og det senere forbud under den vietnamesiske periode beskrives forskelligt fra kilde til kilde.
Genoplivning fra 1990'erne
San Kim Sean nævnes generelt som en central skikkelse i den moderne genoplivning af Bokator. Efter flere år uden for Cambodja vendte han i 1995 tilbage med det formål at gøre kunsten synlig igen. Fra 2001 søgte han efter overlevende lok kru, eller mestre, og arbejdede på at overføre kunsten til en ny generation.
Den første nationale Bokator-konkurrence under den moderne genoplivning fandt ifølge de leverede kilder sted i 2006 i Phnom Penh. Cambodia Kun Bokator Federation blev grundlagt for at støtte træning, dokumentation, seminarer og udveksling mellem mestre.
Anerkendelse og international udbredelse
I 2022 blev Kun Lbokator optaget på UNESCO's repræsentative liste over menneskehedens immaterielle kulturarv. Det er ikke en anerkendelse af ét ensartet teknisk system på verdensplan, men af den kulturelle tradition og bestræbelserne på at bevare den.
Bokator dyrkes i dag også uden for Cambodja, blandt andet gennem diasporasamfund, seminarer og internationale organisationer. I 2023 var Kun Bokator optaget som disciplin under de sydøstasiatiske lege i Cambodja.