Federacja stawiała pierwsze kroki 1990, wywodząc się z grupy pracowników i zawodników klubu bokserskiego z Latsii, założonego 21 czerwca 1982 roku przez trenera Andreasa Ioannou, oraz klubu Krevgas, którego trenerem był Charis Kalapodas. Klub z Idalion był trzecim klubem wpisanym do rejestru Ministerstwa Spraw Wewnętrznych oraz cypryjskiej organizacji sportowej KOA.
Założycielami byli Nikos Karapatakis, Andreas Ioannou, Alekos Alexandrou, Iosif Christodoulou, Andreas Argyrou, Charis Kalapodas i Andreas Karagiorgis. Te trzy kluby utworzyły podstawę, na której federacja 5 lipca 1995 roku otrzymała certyfikat rejestracyjny numer 1593; 30 października 1995 roku została wpisana do rejestru sportowego KOA pod numerem 389.
W latach 1990-1995 federacja nie miała własnych środków, a założyciele sami opłacali wszystkie prace i koszty. W skład pierwszego zarządu wchodzili: prezes Nikos Karapatakis, sekretarz Iosif Christodoulou, skarbnik Alekos Alexandrou oraz członkowie Andreas Karagiorgis i Andreas Ioannou.
W dniach od 12 do 16 grudnia 1990 roku federacja zorganizowała na Cyprze szósty zwyczajny kongres Europejskiej Federacji Bokserskiej EABA, co według federacji było jednym z jej największych sukcesów. Dzięki wsparciu między innymi ówczesnego prezesa EABA Emila Zjetszewa oraz Greckiej Federacji Bokserskiej udało się zarejestrować Cypr w europejskiej federacji EABA i światowej federacji AIBA.